北约为什么要轰炸南联盟，原因很简单是为了科索沃民族矛盾问题。但是要把这个问题讲清楚，需要对科索沃的历史作一个简单的交代。从历史上看科索沃原来属于塞尔维亚人居住的地方，12世纪时科索沃已经成为塞尔维亚王国的一部分。就连科索沃这一名字的来源，也是塞尔维亚语中“黑鸟的土地”的一词。到了14世纪后期，科索沃被奥斯曼土耳其帝国占领，因为战争使得一些阿尔巴尼亚族人也进入科索沃定居。
（前南联盟总统米洛舍维奇）
由于奥斯曼帝国信奉伊斯兰教，针对科索沃的非伊斯兰教民众征收人头税。而塞尔维亚族人信仰东正教，阿尔巴尼亚族人信仰天主教，塞尔维亚族人不堪忍受人头税，陆续的离开了科索沃。而阿尔巴尼亚族人放弃了天主教改为信仰伊斯兰教，哪就免除了人头税之苦。久而久之，科索沃不仅是以阿尔巴尼亚人为主，而且居民被逐步伊斯兰化。过去科索沃以塞尔维亚人为主，反而成为阿尔巴尼亚人为绝对多数，仍然没有迁出的塞尔维亚人比率仅在10%左右。
1991年苏联解体之后的第二年，1992年南斯拉夫也相继解体，一分为六。即斯洛文尼亚、波斯尼亚、克罗地亚、马其顿和南联盟（塞尔维亚和黑山），科索沃属于塞尔维亚的一部分。由于科索沃的大多数居民阿尔巴尼亚人，不愿意留在塞尔维亚，激进闹独立发生了民族冲突。南联盟（塞尔维亚和黑山）派遣军队打击科索沃的分裂，造成了大量的难民逃亡，南联盟派遣了军队和武装警察进入到科索沃。
（北约秘书长斯托尔滕贝格）
塞尔维亚人与阿尔巴尼亚人的矛盾愈演愈烈，塞尔维亚的内部民族矛盾受到美国和北约的特别关注，最后以人道主义为由插手干预了南联盟的科索沃事务。北约轰炸南联盟目的，就是希望肢解塞尔维亚，让科索沃从塞尔维亚独立出来。这仅仅是表面现象，其实质上是美国和北约对于南联盟的意识形态上的偏见。这是因为北约希望颜色颠覆南联盟而不能，这是撇开联合国的军事行动，插手干预科索沃民族矛盾事件。
塞尔维亚社会党主席南联盟领导人米洛舍维奇，是北约视为异类的主要原因。苏联解体之后，几乎一夜之间苏联以及原东欧国家原来政权都改变了颜色，戈尔巴乔夫宣布解释了苏共。其它的东欧国家也是易旗换帜，在政体上向欧盟靠拢，这种现象外界称之为苏东事变。但是在南联盟的米洛索舍奇政权，在北约目光里还是南共，因为塞尔维亚社会党都原身是塞尔维亚共产党。
连俄共都失去了政权，南联盟换了一块牌子米洛舍维奇还在继续执政，这是北约不能容忍的，发动轰炸南联盟战争的主要动因。有了科索沃的民族冲突事件，这就给了北约一个插手干预的借口。北约针对南联盟进行了78天的大规模空中打击，最后北约达到了肢解南联盟的目的。北约这场空中轰炸打击，造成南联盟大约2000 多人死亡， 6000多人受伤。近100万人沦为难民，给南联盟造成的经济损失超过2000 亿美元。因为北约的轰炸，南联盟的新人道主义危机规模，超过了科索沃。